Il complesso monumentale di Santa Chiara, iniziato nel 1310 agli estremi lembi del perimetro della città, rappresenta la più imponente costruzione sacra che sia mai sorta a Napoli. La chiesa ed il doppio monastero, composto dal convento dei frati minori e da quello delle clarisse, sorsero con il titolo originario di Ostia Santa o Corpo di Cristo, ma furono da subito destinati dai sovrani angioini, loro ideatori, all’Ordine dei Minori.

All'interno del sito sono creati dei percorsi tematici che collegano trasversalmente gli oggetti del museo seguendo criteri topografici, cronologici, iconografici, tipologici.